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　　水庫蓄水會造成物種的變遷，其天然溪流季節(jié)周期性特征減弱，甚至變道或改變水流方向。導致水庫周邊的水文地質(zhì)環(huán)境情況產(chǎn)生較大的變化，受到最大影響的主要是生物多樣性、景觀、水質(zhì)、土壤以及其他一些兇素。

　　1、水庫建成蓄水導致的生境變遷

　　從生態(tài)學角度講，溪流的流速、流量、水溫、水深、水質(zhì)和水文周期等都是重要的生態(tài)因子1.在山谷溪流中進行小水電開發(fā)，會在很大程度上改變溪流廊道的徑流特征，對溪流中物質(zhì)能力的輸送產(chǎn)生影響，同時還會對水質(zhì)水文生態(tài)等造成破壞，破壞了河道中生物的數(shù)量和物種的分布，及物種的多樣性和食物鏈同。由于溪流徑流特征產(chǎn)生了變化，例如流量變化、水深水溫變化等，同時也會對天然山谷溪流造成影響，壩前垂向水文呈現(xiàn)出非常明顯的分層現(xiàn)象，水溫的分層讓水庫下層水體溫度持續(xù)的維持在低溫狀態(tài)下，從而造成山谷溪流水溫改變，對四周的水生動植物以及兩岸植被都會帶來負面影響。

　　對于可能造成的這些問題，農(nóng)村小水電站水庫建設(shè)蓄水的解決措施主要有：對于會受到明顯影響的一些動植物，應該結(jié)合其生存的自然環(huán)境以及分布情況，選擇進行遷地保護；對于部分具備洞游特征的某些珍惜瀕危以及特有水生動植物，在進行施工建設(shè)的過程中必須要根據(jù)相關(guān)法律法規(guī)建設(shè)好洄游通道、增殖放流或者異地建設(shè)保護、模擬創(chuàng)造人環(huán)境等手段來開展保護措施。在保證這些對策有效的前提下，施工單位才能正式進行施工，對部分路徑開發(fā)的自然保護、景區(qū)或者森林公園會產(chǎn)生影響的施工段應該實施必要的預防治理、政策補償措施。

　　2、水電站壩上下流域環(huán)境特征的影響

　　當小水電站筑壩完成之后，其上游的水位有了很大的增加，而流速逐漸的變小，因此常常讓過去庫區(qū)山谷溪流段的天然流動水自凈能力降低，水庫蓄水初期常常會造成庫區(qū)和壩下下游水質(zhì)的惡化。如果不能及時的對下游生態(tài)環(huán)境流量安排下泄，還會導致長期性的河段脫水問題。大面積的脫水斷流常常會讓河道水文泥沙的情況發(fā)生改變，從而對區(qū)域內(nèi)的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)以及生活用水安全產(chǎn)生一定的影響。

　　對于農(nóng)村小水電站的開發(fā)與生態(tài)環(huán)境的處理應該盡可能的讓周邊農(nóng)民得到實惠，對于庫區(qū)內(nèi)淹沒的農(nóng)作物和植物要對農(nóng)民進行補償，根據(jù)淹沒面積進行作物仙價，對水域面積進行合理的分配，同時可以扶植農(nóng)戶發(fā)展相關(guān)的養(yǎng)殖業(yè)，或者直接根據(jù)水庫淹沒林地補償標準進行折算，按照每畝2800元左右進行計算。農(nóng)村小水電不僅要能夠正常的發(fā)電，同時還必須保障溪流段的生態(tài)用水。要逐步建立溪流段生態(tài)用水的法律保障機制，全面防止侵占生態(tài)用水的行為，制定溪流生態(tài)流量規(guī)劃，確立溪流最小生態(tài)用水指標。此外，小水電站大壩建成之后往往會對溪流上游魚類產(chǎn)卵帶來一定的阻隔作用，從而造成魚類種群多樣性的損害，我們可以選擇封區(qū)段、封溪段這樣的階梯式保護措施，逐漸的進行生態(tài)修復。